Les concentrations de micro-organismes reliés à la santé humaine dans le ruissellement de parcelles agricoles (0,75m x 2m) traitées avec du fumier de bovin âgé et frais, du lisier de porcs et sans fumier/lisier (contrôle) ont été déterminés. Trois évènements d’averse simulée consécutifs, produisant 35 mm de précipitation et espacés de 24 heures, ont été effectués pour chaque parcelle. Des indicateurs fécaux (Escherichia coli, enterococci, Clostidium perfringens et coliphage) de charges relâchées dans le ruissellement provenant des précipitations des parcelles traitées avec du fumier de bovin frais, du fumier de bovins âgé et du lisier de porc variaient de 5,52 x 10(5) à 4,36 x 10(9), de 3,92 x 10(4) à 4,86 x 10(8) et de 9,63 x 10(5) à 3,05 x 10(8), respectivement. Les concentrations de protozoaires du ruissellement (Cryptospridium oocytes et Giardia cysts) variaient de 1,65 x 10(5) à 1,04 x 10(6), de 2,93 x 10(3) à 2,75 x 10(5) et de 9,12 x 10(4) à 3,58 x 10(6) pour les traitements de fumier de bovins frais, de fumier de bovins âgé et de lisier de porcs, respectivement. Ces résultats suggèrent que lors de grandes précipitations qui produisent du ruissellement, de grandes quantités de microbes pourraient être répandues à partir des champs agricoles où du fumier de bétail a été épandu, même en quantités modestes, et ceci pourrait avoir un impact important sur les cours d’eau à l’intérieur d’un bassin versant. Dû au manque de multiplication dans l’environnement, des concentrations très élevées dans le ruissellement provenant de champs où du fumier/lisier a été épandu et de la corrélation avec la présence de parasites protozoaires, le Clostridium pourrait être un indicateur alternatif de contamination par fumier/lisier du bétail.